İnfluenza A Virüsüne Ait PB1 ve PB2 Alt Birimlerinin Evrimsel ve Yapısal Analiziyle Korunmuş Antiviral ve Aşı Hedeflerinin Belirlenmesi
İnfluenza genomu bir RNA polimeraz kompleksi tarafından kopyalanıp çoğaltılır. İnfluenza RNA polimeraz kompleksi, PB1 ve PB2 alt birimlerinden oluşmakta olup, viral RNA sentezi ve konak hücre proteinleriyle etkileşimde kritik rol oynamaktadır. PB1 alt birimi zincir uzatımının katalitik merkezini oluştururken, PB2 alt birimi konak mRNA’larının 5′ cap yapılarını tanıyarak PA aracılığıyla kesilmesini ve sentez için primer olarak kullanılmasını sağlar. Dolayısıyla, RNA polimeraz kompleksinin moleküler düzeyde incelenmesi, virüsün replikasyon mekanizmasının anlaşılması açısından kritik öneme sahiptir. PB1 ve PB2’nin korunmuş yapısal bölgeleri ile konak protein etkileşimleri, bu alt birimleri hem antiviral ilaç hem de aşı geliştirme çalışmaları için öncelikli hedefler haline getirmektedir. Güncel çalışmalar, PB1 ve PB2 alt birimlerinin aşı ve küçük molekül ilaç geliştirme açısından değerlendirilebilir bağlanma bölgeleri içerdiğini göstermektedir. Bununla birlikte, PB1 ve PB2’nin hedef bölgelerinin evrimsel süreçteki korunma düzeylerine ve seçilim baskılarına ilişkin kapsamlı biyoinformatik analizler henüz yapılmamıştır. Bu proje, PB1 ve PB2 genlerinin 2009–2025 arası varyasyon dinamiklerini, seçilim baskılarını ve yapısal korunum desenlerini birlikte analiz ederek literatürde eksik olan uzun dönemli evrimsel haritalamayı gerçekleştirmeyi amaçlamaktadır.
Helen Üce ve Fatma Sevildağ tarafından yürütülen bu proje TÜBİTAK 2209 proje desteği kazanmıştır.